Kurs Biostatistike u R-u

12 Dec 2024

OPŠTI PODACI

Naziv kursa

Primijenjena statistika u R-u

Institucija koja organizuje kurs

Bosansko-Hercegovačko Herpetološko Udruženje: ATRA (BHHU – ATRA) – www.bhhuatra.com

Predavač

Dr. sc. Emina Šunje (Doctor in de Wetenschappen: Biologie; Doctor of Science: Biology – PhD & Doktor bioloških nauka/znanosti u oblasti ekologije)

Kontakt

e-mail: sunje.emina@gmail.com ; tel: +38761841824

Kome je namjenjen kurs

Početnicima i srednjim korisnicima R-a. Kurs je prvenstveno koristan za studente doktorskog studija, rane (na početku karijere) i iskusne istraživače koji žele nadograditi i poboljšati istraživačke vještine. Studenti magistarskog studija mogu pohađati kurs s naglaskom da kompleksnost nastavnih jedinica može zahtijevati dodatan rad s njihove strane.

Predispozicije za učešće

Minimalno znanje iz statistike i solidno poznavanje engleskog jezika

Broj polaznika

Minimalan broj polaznika za organizaciju kursa je 10 a maksimalan 15

Početak i trajanje kursa

Početak kursa je planiran u zadnjoj sedmici januara 2025. godine, a trajat će 15 sedmica (jedan put sedmično uživo, 6-8 školskih časova (sati)* uključujući i pauzu)

Lokacija kursa

Kandidati koji se prijave će biti naknadno obavješteni o lokaciji održavanja kursa

Kontakt sati *

Ukupno

Predavanja

Vježbe

Konsultacije

140

45

45

50

Samostalan rad (sati)*

60

Relevantnost kursa

Kurs je relevantan za široki raspon naučnih discipilna kao što su: biologija, psihologija, poljoprivreda, farmacija, šumarstvo, veterina, medicina, ekonomija te prateće poddiscipline

* jedan sat = 45 min

 

CILJ KURSA

Cilj kursa je osposobiti polaznike za samostalnu statističku obradu podataka u R-softveru

 

ZADACI KURSA

  • Obezbijediti temelj razumijevanja statističkih osnova: vrste podataka i prateći statistički testovi (teorija)
  • Upoznavanje sa softverima: R i R studio (teorija i praktičan rad)
  • Analiza podataka (deskriptivna statistika; praktičan rad u R - u)
  • Obrada podataka, tj. testiranje hipoteza izvođenjem statističkih testova (univarijantna i multivarijantna statistika; praktičan rad u R- u)
  • Interpretacija rezultata uz generisanje grafičkog prikaza (praktičan rad u R - u)                                                                                         

 

OČEKIVANI REZULTATI

Po završetku kursa, polaznici će biti osposobljeni da:

  • Prevedu istraživačko pitanje u statističku hipotezu
  • Izaberu odgovarajući statistički test ​​za testiranje date hipoteze
  • Izvedu statističke testove u R-u 
  • Tumače ishod statističkog testa i formulišu zaključke istraživačkom terminologijom
  • Samostalno istražuju podatke (varijable) i njihove odnose te identificiraju varijable signifikantne za istraživanu pojavu
  • Temeljno razumiju statističke testove: univarijantna statistika (opšti linearni modeli, generalizirani linearni modeli, mješoviti modeli i dr.), multivarijantna statistika (analiza glavnih komponenti - PCA, linearna diskriminantna analiza, analiza korespondencije, MANOVA, klaster analize i dr.)

 

SADRŽAJ KURSA

Br. sedmice

 

Nastavne teme i jedinice

Sati rada

Kontakt

 

Samostalno

P

V

K

Ukupno

 

1

Otvaranje kursa – uvodno obraćanje i međusobno upoznavanje;

Pregled osnova statistike (tipovi podataka i statističke distribucije, deskriptivna statistika); Uvod u R softver i R studio (R kao digitron, tipovi podataka u R-u [objekti, vektori, matrice...], R paketi i jednostavne funkcije [kvantili, gustine, nasumični brojevi...]); Učitavanje podataka u R- uz praktičnu vježbu analize deskriptivne statistike

 

3

 

3

 

  3

 

9

 

4

2

T test: za jedan i dva uzorka (one- and two-sample test), Wilcoxon test, bootstrap i permutacije - primjeri i praktične vježbe (zadaci)

3

3

  3

9

4

3

Jednostavna (prosta) linearna regresija, upotreba bootstrap i permutacije u slučajevima linearne regresije - primjeri i praktične vježbe

3

3

  2

8

4

 

4

Višestruka (linearna) regresija, višestruka regresija sa interakcijom, višestruka regresija sa nelinaearnom varijablom, kros-validacija za testiranje kvaliteta modela i alat za selekciju modela - primjeri i praktične vježbe

3

 

 

3

 

 

 

 

3

 

 

 

 

9

 

 

4

5

ANOVA – one way anova (anova sa jednom varijablom) i two-way anova (anova sa dvije varijable); Post hoc analize - primjeri i praktične vježbe

  3

3

  3

9

4

6

ANCOVA – analiza sa kovarijantom, primjeri i praktične vježbe

  3

   3

  3

9

3

7

Opšti linearni modeli – primjeri i praktične vježbe

  3

   3

  3

9

4

8

Generalizirani linearni modeli (chi kvadrat test, Simpsonov paradoks, riješavanje problema overdisperzije): primjeri i praktične vježbe

 

 4

 

   4

 

  5

 

13

 

5

9

Generalizirani mješoviti modeli: primjeri i praktične vježbe

4

4

5

13

5

10

Multivarijantna statistika: uvod i vizualizacija multivarijantnih podataka; multivarijantne distance (odmaci) i MANOVA, praktične vježbe

3

3

5

11

5

11

Multivarijantna statistika: analiza glavnih komponenti – PCA – primjeri i praktične vježbe

4

4

5

13

4

12

Multivarijantna statistika: klaster analize - primjeri i praktične vježbe

3

3

3

9

4

13

Multivarijantna statistika: diskriminantna analiza - primjeri i praktične vježbe

3

3

3

9

3

14

Multivarijantna statistika: kanonička korelacija i analiza korespondencije – primjeri i praktične vježbe

3

3

4

10

4

15

Ispit – provjera znanja

 

/

/

/

/

/

 

Ukupno

 

45

45

50

140

60

 

METODE NAUČNO-NASTAVNOG RADA

Podrazumijevaju:

    • teorijska predavanja (ppt prezentacije i pdf fajlovi)
    • intereaktivna komunikacija
    • video materijal (sopstveni video zapisi na youtube kanalu predavača i odabrani video zapisi)
    • praktičan rad u R- u uz mogućnost analize ličnih podataka

 

Svi naučno-nastavni materijali bit će dostupni kandidatima u elektronskoj formi.

 

PROVJERA ZNANJA (ISPIT)

Nakon završetka kursa, bit će organizovan jedan pismeni ispit bez usmenog izlaganja. Ispit se sastoji od ukupno šest zadataka od kojih je svaki vezan za specifičnu vrstu podataka te odgovarajuće statističke analize. Za četiri zadatka predstavljen je rezultat analize i potrebno je odgovoriti na konkretno pitanje i prateća podpitanja uz esejsko obrazloženje. Za preostala dva zadatka, analize se moraju obaviti u R-u a zaključak analize treba interpretirati. Nivo težine ispita je uporediv sa onim tokom vježbi.

Polaznicima je dozvoljeno da konsultuju bilješke o kursu, rješenja vježbi i druge knjige ako iste smatraju korisnim za riješavanje datih zadataka (ispit je po principu otvorene knjige). Ispit traje maksimalno 240 minuta i potrebno je osvojiti 55% od ukupnih bodova za uspješan prolaz.

 

CERTIFIKAT

Nakon završetka kursa svi polaznici će dobiti certifikat o učešću na kursu. Certifikat će sadržavati QR kod koji će voditi na web stranicu Udruženja gdje će biti prikazan sadržaj nastavnih jedinica koje su pređene tokom kursa.

Polaznici koji uspješno polože ispit dobijaju „Certifikat o odslušanom i uspješno položenom kursu statistike u R-u“.

Polaznici koji ne polože ispit dobijaju „Certifikat o odslušanom kursu statistike u R-u“.

Polaznici koji ne polože ispit, imat će priliku za još jedan dodatni ispitni rok uz uplatu od 120,00 KM koja ne garantira prolaz!

 

CIJENA KURSA

Cijena kursa iznosi 790,00 KM, uz mogućnost plaćanja na tri rate. Studenti magistarskog studija i nezaposleni polaznici imaju 20% popusta uz priloženi dokaz o statusu (dokaz o studiranju ili potvrda s biroa).

Zainteresirani polaznici moraju osigurati svoje mjesto na kursu uplatom od 100,00 KM. Prvih 15 koji uplate 100,00 KM će imati osigurano učešće. Ako se uplata izvrši nakon popunjavanja svih mjesta, kandidati mogu odlučiti da zadrže uplaćeni iznos na računu Udruženja čime će si osigurati mjesto za naredni kurs R-a (najkasnije godinu dana nakon ovog kursa) ili da im se izvrši povrat novca. Uplaćenih 100 KM se odbija od ukupne cijene kursa, koja tako iznosi 690,00 KM..

 

INSTRUKCIJE PLAĆANJA

Uplata za osiguravanje mjesta na kursu (kao i sve naknadne uplate) treba da se izvrši na broj računa BHHU – ATRA kako slijedi. Dokaz o izvršenoj uplati  (uslikana uplatnica) potrebno je poslati na e-mail: sunje.emina@gmail.com

 

Slika 1. Uplatom kotizacije od 100,00 KM  kandidat osigurava svoje učešće na kursu. Prvih 15 kandidata koji izvrše uplatu kotizacije postaju učesnici kursa. Preostalu uplatu od 690,00 KM moguće je realiziratii kroz tri rate.

 

LITERATURA

Literaturu obezbjeđuje predavač u pdf-formatu:

  • Field, A., Miles, J, Field Zoe (2012): Discovering statistics using R. Sage Publications Ltd
  • Crawley, M. (2007): The R book. John Wiley & Sons. The Atrium, Southern Gate, Chichester, West Sussex, England
  • Van Dongen, S. (2011): Short R tutorial, course notes and excersises for the Biostatistic course. University of Antwerpen

 

 

Objavio: Emina Zadnji update: 2024 Dec 12 22:15
Vrh